以大科技醫藥行業解決方案既可適用于醫藥批發企業和零售連鎖企業，同時也可適用于批零兼營企業。系統功能模塊劃分如下：
一、總部管理系統
基本資料：包括字典表，商品管理，供應商管理，批發客戶管理等。
1、門店業務管理：零售連鎖企業對各零售店的管理，包括零售店的要貨配貨處理，零售店退貨和調撥業務處理。
2、采購管理：包括采購訂單管理，采購退貨處理，電子定單處理等。
3、批發銷售管理：包括銷售訂單處理，銷售退貨處理，應收帳款，發票管理。
4、財務管理：包括應付帳款管理，綜合查詢。
5、營銷管理：包括促銷管理，調價管理。
6、庫存控制管理：包括對各零售店庫存管理和控制。
7、業績考核管理：包括采購業績考核和門店業績考核。
8、會員管理：包括會員基本資料，會員消費查詢，會員信息處理。
9、GSP管理：包括供應商證照管理，首次經營企業管理，首次經營藥品管理，進口藥品及證照管理，商品檔案管理，不合格和退貨商品管理，滯銷和近效期商品管理。
10、盤點管理：包括對配送中心和各門店倉庫的盤點管理。
11、員工檔案管理：包括公司內部的員工管理和機構管理。
12、接口通訊管理：根據客戶需求提供與企業已有業務系統的數據接口通訊模塊，如金稅工程，社保系統等，實現各業務系統之間的數據共享。
13、日結通訊：包括日結數據處理，月結數據處理及轉帳，總部與配送中心，零售門店數據傳輸，數據備份。
二、物流配送信息管理系統
基本資料：包括區域資料、省份資料、城市資料、物流中心資料、作業班組資料、行車路線資料、倉間和倉儲位資料。
1、進貨作業：進貨作業處理正常。
入庫和客退作業。正常入庫作業，根據總部的入庫指示(預先通知或不通知)，將良品放置于良品庫,不良品放置于待處理區，每日入庫結束后打印入庫管制表反饋給總部。如果須接貨，還應包括從第三地將商品運送到物流中心的過程。客退作業包括兩種：直接退貨和銷售退貨，系統對這兩種退貨方式作出不同的管理。
2、出貨作業：依據總部的出貨指示(出貨通知單)的要求，再經物流中心確認、配車、揀貨、出貨后，庫存量相應減少，出貨后，還應輸入回單資料及拒收原因，完成后打印配送管制表，以告知總部每日配送完成情況。
3、存量管理：庫存管理包括對存量的調整、盤點作業、移倉、溫濕度記錄以及庫存查詢和異動查詢。
4、調撥作業：依總部指示，將貨物從一物流倉庫調撥到他處物流倉庫。
5、流通加工：流通加工主要對商品進行改包裝、貼標牌、組裝(BOM表)處理等，將來會成為第三方物流的重要利潤來源之一。本模塊為獨立模塊，有一套完整的作業流程和數據處理過程。
6、車輛管理：車輛管理的目的在于控制車輛運行費用，大限度提高運能。
7、GSP管理：包括商品養護管理，商品進出驗貨管理，倉庫溫濕度記錄管理，商品批號跟蹤。
三、連鎖門店管理系統
基本資料：括收銀員資料，柜組資料，柜組商品資料，中藥飲片加工資料，藥品拆零資料，配伍禁忌資料等。
1、門店業務：包括門店請貨單，退貨申請單，調撥單，門店報損單等。
2、庫存管理：包括門店庫存的盤點，庫存調整，批號調整，中藥飲片加工，藥品拆零等。
3、GSP管理：進貨驗收管理，商品拆零記錄，飲片裝斗記錄，藥品養護記錄，藥品退庫記錄，特殊藥品驗收記錄，處方審核記錄等。