藥品流通現代化經營模式正成為醫藥流通企業掌握未來的有效手段，醫藥產業的競爭將向“大集團、大品種、大市場”戰略方向靠攏，要想在激烈的市場競爭中謀求發展，客觀上要求企業必須加強內部管理，提高運營效率。在當今高度信息化的時代，越來越多的醫藥經營企業意識到提高企業管理水平的重要性，也迫切要求加快管理信息化的進程。醫藥連鎖機構維系業務正常運行以及建立核心競爭力的基礎之一就是擁有高效、穩定的信息系統。
通過連鎖配送管理系統( 簡稱"ECMS" )管理醫藥連鎖企業可以實現對各分店進行的一系列經營管理（品類管理、庫存管理、會員管理、促銷策略、報表分析等），實時監控分析各個分布門店POS運營數據，不僅做到分布門店統一管理，而且個性化設置門店運營模式，從而迅速建立和完善現代企業的信息化管理機制問題。連鎖配送管理系統ECMS的應用將幫助企業加速精細化管理和提高企業的核心競爭力，輕松實現規模化、效益化的超常規發展。
醫藥門店管理軟件是一款具有零售前臺POS管理、購進業務管理、批發業務管理、物流配送管理、庫存管理、物價管理、財務帳目管理（商品會計管理）、業務數據查詢管理、小帳簿管理、分析決策管理、資料檔案管理、藥品質量管理（GSP）、連鎖總店管理、連鎖分店管理、總店分店數據通訊管理、錯誤票據管理、系統稽查日志管理等功能摸塊的軟件。
醫藥門店管理軟件的功能和特點：
1、軟件從功能上主要分為零售前臺POS管理、購進業務管理、批發業務管理、物流配送管理、庫存管理、物價管理、財務帳目管理（商品會計管理）、業務數據查詢管理、小帳簿管理、分析決策管理、資料檔案管理、藥品質量管理（GSP）、連鎖總店管理、連鎖分店管理、總店分店數據通訊管理、錯誤票據管理、系統稽查日志管理等功能摸塊。
另外還有強大的二次開工具（自定義單據、自定義查詢、自定義打印（套打）、自定義定義業務流程）；軟件從業務模式上主要適合醫藥批發、零售、批發兼零售和連鎖超市及配送等，從系統操作平臺主要分單機版和網絡版、廣域網版等功能組成。
2、商品質量管理(GSP管理)：系統緊隨國家藥品質量管理政策，系統提供詳細的管理報表如首次經營藥品審批表、采購藥品通知單、驗收報表、藥品養護檔案表、不合格藥品表、報廢藥品銷毀表、退貨通知單、及藥品質量相關臺帳。如：藥品驗收紀錄、銷售紀錄、出庫復核記錄、退貨臺帳等。
3、決策報表：
零售提供：零售商品匯總表、收銀員匯總報表、營業員匯總報表、零售流水表等管理報表；
庫存提供：進、銷、存帳表、庫存總帳及明細帳、廠商（產地）庫存余額、效期報警、庫存積壓分析、銷售未出、進貨未入商品匯總及明細表；
銷售提供：商品銷售匯總及明細分析表、客戶銷售匯總及明細分析表、業務員銷售匯總及明細分析表、商品銷售成本匯總及明細分析表；
進貨提供：商品進貨匯總及明細分析表、客戶進貨匯總明細分析表、業務員進貨匯總明細分析表；
往來帳提供：應收應付、預收預付款匯總及明細帳及應收應付帳齡分析。